中国能建新疆院长期以来不仅锻炼了一支能打硬仗的设计队伍，也积累了丰富的项目管理实践经验。中国能建新疆院积极倡导以设计为龙头的总承包业务取得显著成绩，总承包业务范围涉及输变电、火力发电、热电联产、水电站、新能源风电、太阳能光伏项目等各个领域，为进一步实施战略转型起到了积极的促进作用。 

    2005年，承担了国家战略性重点工程阿拉山口泵站-独山子炼油厂输油管道工程和西部原油成品油管道的外供电建设工程，标志着中国能建新疆院EPC业务有了质的飞跃。

    2007年，承接了乌石化热电厂升压站和220千伏达风升压站扩建工程，使总承包业务迈向了220千伏新台阶。同年，首次以总承包的方式承接了新疆电力公司和田-布雅110千伏输变电项目。

    2008年，承揽了首个发电总承包项目图木舒克热电联产工程，标志着总承包业务向发电市场实现历史性的突破，并于2010年实现了年内“双投”的目标。

    2010 年，借助在风电设计上的优势，连续承揽了哈密十三间房风电等多项新能源总包业务。

    2011年2月，联合中标阿拉尔新沪热电厂二期2×350兆瓦超临界空冷供热机组扩建工程EPC工程总承包项目，标志着中国能建新疆院再次在发电总承包领域实现重大突破，从此迈上了350兆瓦超临界火电机组EPC总承包工程的新台阶。

    2011年9月，与伊犁川宁生物技术有限公司成功签订伊犁川宁生物技术有限公司万吨抗生素中间体项目配套热电站工程总承包合同。

    2012 年，陆续承接了新疆宜化有限公司自备电厂220千伏输变电工程、新疆农六师铝业有限公司220千伏保安联络站输变电工程等一批后期续建工程，标志着中国能建新疆院总承包业务水平在疆内得到广泛认可。

    2013年1 0月，陆续签订了新疆国泰新华准东一期220千伏总变电站工程EPC总承包合同、新建红柳河至淖毛湖矿区电气化铁路牵引站接入系统工程(南部)EPC总承包合同。其中新建红柳河至淖毛湖矿区电气化铁路牵引站接入系统工程是中国能建新疆院首个电气化铁路牵引系统EPC总承包项目，标志着中国能建新疆院总承包业务在新的领域更迈进一步。

    2014年，签订能源哈密风电二期烟墩(七B)整装20万千瓦风电项目及能源哈密烟墩风间带10万千瓦光伏发电总承包项目 。