中国能建新疆院在综合管理方面取得了较好成绩，连续十年获得自治区“精神文明单位”光荣称号。2004年获得 “工程勘察设计资质年检免检单位”称号； 2005年2月17日通过了国家“三标一体”认证审核，是全国省级电力设计院中第四家获得认证的单位，并保持至今;同年获得中国科技市场协会“金桥奖”；2006年获得建设部“（十五）全国建筑业技术创新先进企业”； 2008年获得中国电力规划协会“AAA级企业信用单位”及新疆勘察设计协会“诚信单位”至今； 2010年首次取得中国勘察设计协会和全国工程勘察与岩土行业“诚信单位”至今；2010年获得“新疆与西北750千伏联网工程建设功勋单位”和新疆电力公司“电网建设先进单位”荣誉称号；2012年被自治区总工会授予“开发建设新疆奖状”；同年，被科技部火炬高新技术产业开发中心认定为新疆2012年首批高新技术企业，2016年被再次认定为高新技术企业,2016年获得“全国电力行业用户满意企业”。